(1) 原核生物のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く）
Acinetobacter baumannii
Acinetobacter calcoaceticus
Actinobacillus capsulatus
Actinobacillus equuli
Actinobacillus lignieresii
Actinobacillus pleuropneumoniae
Actinobacillus suis
Actinobacillus ureae（旧分類名Pasteurella ureae）
Actinomadura madurae
Actinomadura pelletieri
Actinomyces bovis
Actinomyces israelii
Actinomyces viscosus
Aeromonas hydrophila
Aeromonas sobria
Aeromonas veronii
Aggregatibacter actinomycetemcomitans
Anaplasma bovis
Anaplasma marginale
Anaplasma ovis
Anaplasma phagocytophilum
Arcanobacterium haemolyticum
Avibacterium paragallinarum
　　　　（別名Haemophilus paragallinarum）
Bacillus anthracis（34F2株及びDavis株に限る。）
Bacillus cereus
Bacteroides fragilis
Bartonella alsatica
Bartonella bacilliformis
Bartonella birtlesii
Bartonella bovis
Bartonella capreoli
Bartonella clarridgeiae
Bartonella doshiae
Bartonella elizabethae
Bartonella grahamii
Bartonella henselae
Bartonella koehlerae
Bartonella quintana
Bartonella schoenbuchensis
Bartonella taylorii
Bartonella tribocorum
Bartonella vinsonii
Bibersteinia trehalosi（旧分類名Pasteurella trehalosi）
Bordetella avium
Bordetella bronchiseptica
Bordetella holmesii
Bordetella parapertussis
Bordetella pertussis
Borrelia属全種
Brachyspira hyodysenteriae
　　　　（別名Serpulina hyodysenteriae）
Brachyspira innocens
Brachyspira pilosicoli
Burkholderia cepacia
Campylobacter coli
Campylobacter fetus
Campylobacter jejuni
Capnocytophaga canimorsus
Capnocytophaga cynodegmi
Capnocytophaga gingivalis
Capnocytophaga granulosa
Capnocytophaga haemolytica
Capnocytophaga leadbetteri
Capnocytophaga ochracea
Capnocytophaga sputigena
Cardiobacterium hominis
Chlamydia muridarum
Chlamydia suis
Chlamydia trachomatis
Chlamydophila abortus
Chlamydophila caviae
Chlamydophila felis
Chlamydophila pecorum
Chlamydophila pneumoniae
Chlamydophila psittaci
Chromobacterium violaceum
Citrobacter freundii
Citrobacter rodentium
Clostridioides difficile（旧分類名Clostridium difficile）
Clostridium argentinense
Clostridium botulinum
Clostridium butyricum(ボツリヌス毒素産生株に限る。）
Clostridium chauvoei
Clostridium colinum
Clostridium haemolyticum
Clostridium histolyticum
Clostridium novyi
Clostridium perfringens
Clostridium piliforme
Clostridium septicum
Clostridium sporogenes
Clostridium tetani
Corynebacterium diphtheriae
Corynebacterium jeikeium
Corynebacterium kutscheri
Corynebacterium pseudodiphtheriticum
Corynebacterium pseudotuberculosis
Corynebacterium renale
Corynebacterium ulcerans
Ehrlichia canis
Ehrlichia chaffeensis
Ehrlichia ewingii
Ehrlichia muris
Elizabethkingia
meningoseptica（ 旧分類名Chryseobacterium meningosepticum）
Enterobacter asburiae
Enterobacter cloacae
Enterococcus faecalis（ﾊﾟﾝｺﾏｲｼﾝ耐性株に限る。）
Enterococcus faecium（ﾊﾟﾝｺﾏｲｼﾝ耐性株に限る。）
Erysipelothrix rhusiopathiae
Erysipelothrix tonsillarum
Escherichia albertii
Escherichia coli
　　　　（腸管、尿路等における病原性を有する株に限る。）
Facklamia sourekii
Filobacterium rodentium
Fluoribacter bozemanae
Fluoribacter dumoffii
Fluoribacter gormanii
Francisella hispaniensis
Francisella philomiragia
Francisella tularensis subsp. holarctica（LVS株に限る。）
Francisella tularensis subsp. novicida（旧分類名Francisella novicida）
Francisella tularensis subsp. tularensis（B38株に限る。）
Fusobacterium necrophorum
Fusobacterium nucleatum
Haemophilus aegyptius
Haemophilus ducreyi
Haemophilus influenzae
Haemophilus parainfluenzae
Haemophilus parasuis
Helicobacter bilis
Helicobacter bizzozeronii
Helicobacter canadensis
Helicobacter canis
Helicobacter cinaedi
Helicobacter felis
Helicobacter fennelliae
Helicobacter heilmannii
Helicobacter hepaticus
Helicobacter pullorum
Helicobacter pylori
Helicobacter salomonis
Helicobacter suis
Histophilus somni（旧分類名Haemophilus somnus）
Klebsiella aerogenes
Klebsiella granulomatis
Klebsiella oxytoca
Klebsiella pneumoniae
Lawsonia intracellularis
Leclercia adecarboxylata
Legionella属全種
Leptospira interrogans
Listeria ivanovii
Listeria monocytogenes
Mannheimia haemolytica
　　　　（旧分類名Pasteurella haemolytica）
Moraxella bovis
Moraxella catarrhalis
Moraxella ovis
Moraxella saccharolytica
Mycobacterium abscessus
Mycobacterium asiaticum
Mycobacterium avium
Mycobacterium branderi
Mycobacterium celatum
Mycobacterium chelonae
Mycobacterium flavescens
Mycobacterium fortuitum
Mycobacterium gadium
Mycobacterium gastri
Mycobacterium genavense
Mycobacterium gordonae
Mycobacterium haemophilum
Mycobacterium intracellulare
Mycobacterium kansasii
Mycobacterium leprae
Mycobacterium lepraemurium
Mycobacterium malmoense
Mycobacterium marinum
Mycobacterium mucogenicum
Mycobacterium neoaurum
Mycobacterium nonchromogenicum
Mycobacterium rhodesiae
Mycobacterium scrofulaceum
Mycobacterium senegalense
Mycobacterium shimoidei
Mycobacterium simiae
Mycobacterium sphagni
Mycobacterium szulgai
Mycobacterium thermoresistibile
Mycobacterium tuberculosis var. capare
（旧名称Mycobacteriumcaprae）
Mycobacterium tuberculosis var. microti
（旧名称Mycobacterium microti）
Mycobacterium ulcerans
Mycobacterium vaccae
Mycobacterium xenopi
Mycoplasma属全種
　　　　（Mycoplasma mycoides subsp. mycoidesを除き、
　　　　Mycoplasma mycoides subsp. mycoides（V株）を含む。）
Neisseria gonorrhoeae
Neisseria meningitidis
Neorickettsia risticii
Neorickettsia sennetsu
Nocardia abscessus
Nocardia aobensis
Nocardia arthritidis
Nocardia asteroides
Nocardia beijingensis
Nocardia brasiliensis
Nocardia concava
Nocardia cyriacigeorgica
Nocardia elegans
Nocardia farcinica
Nocardia niigatensis
Nocardia nova
Nocardia otitidiscaviarum
Nocardia paucivorans
Nocardia puris
Nocardia vinacea
Ochrobactrum anthropi
Paeniclostridium sordellii
　　　　（旧分類名Clostridium sordellii）
Pasteurella multocida
　　　　（出血性敗血症又は家きんコレラ由来ではない株に限る。）
Photobacterium damselae
Plesiomonas shigelloides
Porphyromonas gingivalis
Prevotella intermedia
Proteus mirabilis
Proteus penneri
Proteus vulgaris
Providencia rettgeri
Pseudomonas aeruginosa
Rhodococcus hoagii（旧分類名Rhodococcus equi）
Riemerella anatipestifer
Rodentibacter pneumotropicus
　　　（旧分類名Pasteurella　pneumotropica）
Rothia dentocariosa
Salmonella属全種
　　　　（S.enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A、
　　　　S.enterica subsp.enterica serovar Typhi、
　　　　S.enterica subsp. enterica serovar TyphimuriumのTA98株、 
　　　　TA100株及びTA1535株並び にS.subterraneaを除く。）
Serratia liquefaciens
Serratia marcescens
Serratia rubidaea
Shigella属全種
Simkania negevensis
Staphylococcus aureus
Staphylococcus hyicus
Streptobacillus moniliformis
Streptococcus acidominimus
Streptococcus agalactiae
Streptococcus anginosus
Streptococcus canis
Streptococcus constellatus subsp. constellatus
Streptococcus constellatus subsp. pharyngis
Streptococcus dysgalactiae
Streptococcus equi
Streptococcus intermedius
Streptococcus parasanguinis
Streptococcus pneumoniae
Streptococcus porcinus
Streptococcus pyogenes
Streptococcus ruminantium
Streptococcus sanguinis
Streptococcus sinensis
Streptococcus suis
Streptococcus uberis
Tannerella forsythia
Tatlockia micdadei
Taylorella equigenitalis
Treponema carateum
Treponema denticola
Treponema pallidum
Treponema paraluiscuniculi
Treponema pertenue
Tropheryma whipplei
Trueperella bernardiae（旧分類名Arcanobacterium bernardiae）
Trueperella pyogenes（旧分類名Arcanobacterium pyogenes）
Ureaplasma urealyticum
Vibrio cholerae
Vibrio fluvialis
Vibrio mimicus
Vibrio parahaemolyticus
Vibrio vulnificus
Yersinia enterocolitica
Yersinia frederiksenii
Yersinia intermedia
Yersinia pseudotuberculosis

(2) 真菌のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く。） 
Aspergillus属全種
Candida属全種
Chaetomium属全種（毒素産生株に限る。）
Cladosporium属全種
Cryptococcus gattii
Cunninghamella属全種
Cryptococcus neoformans
Epidermophyton floccosum
Exophiala dermatitidis
Fonsecaea pedrosoi
Fusarium属全種（毒素産生株に限る。）
Microsporum属全種
Mucor属全種
Myrothecium属全種（毒素産生株に限る。）
Penicillium属全種
　　　　（毒素産生株に限り、Penicillium marneffeiを除く。）
Pneumocystis属全種
Rhizopus属全種
Scedosporium属全種
Sporothrix schenckii
Trichophyton属全種
Trichosporon属全種

(3) 原虫のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く。）
Acanthamoeba属全種
Babesia属全種
Balamuthia mandrillaris
Balantidium coli
Besnoitia属全種
Buxtonella sulcata Caryospora属全種
Cryptosporidium属全種
Cyclospora属全種
Eimeria属全種
Entamoeba属全種
Giardia属全種
Haemoproteus属全種
Hammondia hammondi Hartmannella属全種
Hepatocystis属全種
Hepatozoon属全種
Hexamita属全種
Histomonas meleagridis Isospora属全種
Leishmania属全種
Leucocytozoon属全種
Microsporidium門全種
Naegleria属全種
Neospora caninum
Pentatrichomonas hominis
Plasmodium属全種（齧歯類に感染するものを除く。）
Sarcocystis属全種
Tetratrichomonas gallinarum
Theileria属全種
Toxoplasma gondii
Trichomonas vaginalis
Tritrichomonas foetus

(4) 寄生虫のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く。）
Abbreviata属全種
Acanthoparyphium属全種
Aelurostrongylus属全種
Agriostomum属全種
Alaria属全種
Amoebotaenia属全種
Ancylostoma属全種
Angiostrongylus属全種
Anisakis属全種
Anoplocephala属全種
Ascaridia属全種
Ascaris属全種
Ascarops属全種
Aspiculuris属全種
Avioserpens属全種
Avitellina属全種
Baylisascaris属全種
Bertiella属全
Brachylaemus属全種
Brugia属全種
Bunostomum属全種
Calicophora属全種
Camallanus属全種
Capillaria属全種
Chabertia属全種
Cheilospirura属全種
Choanotaenia属全種
Clonorchis属全種
Cooperia属全種
Cordonema属全種
Cotugnia属全種
Cotylurus属全種
Craterostromum属全種
Crenosoma属全種
Cyathostoma属全種
Cyathostomum属全種
Cylicocyclus属全種
Cylicodontophorus属全種
Cylicospirura属全種
Cylicostephanus属全種
Davaincoides属全種
Davainea属全種
Demodex canis Dicrocoelium属全種
Dictyocaulus属全種
Digramma属全種
Dioctophyme属全種
Dipetalonema属全種
Diphyllobothrium属全種
Diplogonoporus属全種
Dipylidium属全種
Dirofilaria immitis Dracunculus属全種
Draschia属全種
Echinocephalus属全種
Echinochasmus属全種
Echinococcus属全種
Echinostoma属全種
Elaeophora属全種
Enterobius属全種
Euparyphium属全種
Eurytrema属全種
Fasciola属全種
Fascioloides属全種
Fasciolopsis属全種
Filaroides属全種
Fimbriaria属全種
Fischoederius属全種
Gaigeria属全種
Gasterophilidae科全種
Gastrodiscoides属全種
Gigantobilharzia属全種
Globocepharus属全種
Gnathostoma属全種
Gongylonema属全種
Gyalocephalus属全種
Habronema属全種
Haemonchus contortus
Heligmosomoides polygyrus Heterakis属全種
Heterobilharzia属全種
Heterophyes属全種
Himasthla属全種
Homalogaster属全種
Hymenolepis属全種 Hyostrongylus属全種
Hypoderaeum属全種 Inermicapsifer属全種
Kudoa septempunctata Lagochilascaris属全種
Ligula属全種
Linguatula属全種
Litomosoides sigmodontis
Loa loa Mammomonogamus属全種
Mansonella属全種
Mecistocirrus属全種
Mesocestoides属全種
Metagonimus属全種
Metastrongylus属全種
Metroliasthes属全種
Microbilharzia属全種
Micropleura属全種
Microtetrameres属全種
Molineus属全種
Moniezia属全種
Muellerius属全種
Nanophyetus属全種
Necator属全種
Nematodirus属全種
Nippostrongylus brasiliensis
Notocotylus属全種
Oesophagodontus属全種
Oesophagostomum属全種
Oestrus属全種
Ollulanus属全種
Onchocerca属全種
Opisthorchis属全種
Ornithobilharzia属全種
Orthocoelium属全種
Osteophagostomum属全種
Ostertagia属全種
Oxyspirura属全種
Oxyuris属全種
Parafilaria属全種
Paragonimus属全種
Paramphistomum属全種
Paranoplocephala属全種
Parascaris属全種
Paryphostomum属全種
Passalurus属全種
Pharyngostomum属全種
Philometra属全種
Philometroides属全種
Physaloptera属全種
Physocephalus属全種
Plagiorchis属全種
Poteriostomum属全種
Probstmayria属全種
Prosthogonimus属全種
Protostrongylus属全種
Pseudoterranova属全種
Psoroptes属全種
Raillietina属全種
Rhabditis属全種
Schistosoma属全種
旋尾線虫タイプX
Setaria属全種
Simondsia属全種
Skrjabinema属全種
Sobolevicephalus属全種
Sparganum proliferum Spirocerca属全種
Spirometra属全種
Spirura属全種
Stephanofilaria属全種
Stephanurus属全種
Stichorchis属全種
Stilesia属全種
Strongyloides属全種
Strongylus属全種
Suifilaria属全種
Syngamus属全種
Synhimantus属全種
Taenia属全種
Tanqua属全種
Terranova属全種
Tetrameres属全種
Thelazia属全種
Thysaniezia属全種
Thysanosoma属全種
Toxascaris属全種
Toxocara属全種
Trichinella属全種
Trichobilharzia属全種
Trichostrongylus属全種
Trichuris属全種
Triodontophorus属全種
Uncinaria属全種
Wuchereria bancrofti

(5) 真核生物を自然宿主とするウイルスのうち、イ及びロに掲げるもの

イ 次に掲げるもの（承認生ワクチン株を除く。）
Adenovirus
Aguacate virus
Aichivirus A
Aichivirus B
Alcelaphine herpesvirus 1
Alenquer virus
Alethinophid 1 reptarenavirus
Alethinophid 2 reptarenavirus
Alethinophid 3 reptarenavirus
American dog tick phlebovirus
Apoi virus
Arbia virus
Armero virus
Aroa virus
Arumowot virus
Asama virus
Avastrovirus（旧分類名Aviastrovirus）
Avian encephalomyelitis virus
Avian hepatitis E virus
Avian metapneumovirus（別名Turkey rhinotrachitis virus）
Avian paramyxovirus
Avian orthoreovirus
Avian retrovirus
Aviastrovirus
Avihepatovirus
Avipoxvirus
Bat mumps virus
Bebaru virus
Blacklegged tick phlebovirus 1
Bole Tick Virus 1
Border disease virus
Borna disease virus
Bovine astrovirus
Bovine ephemeral fever virus
Bovine herpesvirus
Bovine papular stomatitis virus
Bovine respiratory syncytial virus
Bovine rhinitis A virus
Bovine rhinitis B virus
Bovine viral diarrhea virus
Candiru virus
Canine distemper virus
Canine herpesvirus
Cardiovirus（Encephalomyocarditis virus
　　　　及びTheiler's murine encephalomyeltits virusを含む。）
　　　　（旧分類名Theilovirus）
Caviid herpesvirus 1
Cetacean morbillivirus
Chagres virus
Chandipura vesiculovirus
Chicken anemia virus
Chize virus
Coronavirus
　　　　（MERS coronavirus、SARS coronavirus及びSARS Coronavirus
　　　　（SARS coronavirusを除く。）coronavirus 2を除く。）
Cosavirus A
Cowpox virus
Cytomegalovirus
Dabieshan Tick Virus
Dengue virus
Dhori virus
Duck hepatitis virus
Duck hepatitis B virus
Duck herpesvirus 1
　　　　（別名Duck plague virus、Duck enteritis virus）
Dugbe virus
Durania virus
Ectromelia virus
Enterovirus A（旧分類名Human enterovirus A）
Enterovirus B（旧分類名Human enterovirus B）
Enterovirus C（Poliovirus 1, 2, 3を含む。）
　　　　（旧分類名Human enterovirus C）
Enterovirus D（旧分類名Human enterovirus D）
Enterovirus E
Enterovirus F
Enterovirus G（旧分類名Porcine enterovirus B）
Enterovirus H（旧分類名Simian enterovirus A）
EpsteinBarr（略称EB）virus
Equine arteritis virus
Equine herpesvirus
Equine rhinitis A virus
Erbovirus A
Feline herpesvirus
Feline morbillivirus
FinV707 virus
Forecariah virus
Fukuoka virus
Gabek Forest virus
GB virus B
Getah virus
Ghana virus
Goatpox virus
Gordil virus
Gossas virus
Grand Arbaud virus
Hazara virus
Hepatitis A virus
Hepatitis B virus
Hepatitis C virus
Hepatitis D virus
Hepatitis E virus
Hepatitis G virus
Herpes simplex virus 1,2
Horsepox virus
Huangpi Tick Virus 2
Human astrovirus
Human herpesvirus 6,7,8
Human immunodeficiency virus（略称HIV）
　　　　１（増殖力等欠損株（自立的な増殖力及び感染力を保持せず、
　　　　　かつ、哺乳動物等に対する病原性がない株であって、
　　　　　使用等を通じて自立的な増殖力及び感染力又は病原性を獲得
　　　　　することがないものをいう。以下同じ。）に限る。）
Human metapneumovirus
Human respiratory syncytial virus
Ilheus virus
Infectious bursal disease virus
Infectious
laryngotracheitis virus
Influenza virus
　　　　（高病原性株（Highly pathogenic avian influenza
　　　　 virusを含む。）を除く。）
Issyk-Kul virus
Itaituba virus
Ixcanal virus
Japanese encephalitis virus
Jingmen tick virus group virus
Junin virus（Candid#1株に限る。）
Kabuto Mountain virus
Karimabad virus
Kasokero orthonairovirus
Keterah virus
Khabarovsk virus
Khasan virus
Kismayo virus
Komandory virus
Kunjin virus
Kuriyama virus
Lactate dehydrogenase-elevating virus
Lagovirus
Langat virus
Latino virus
LCM（Lymphocytic choriomeningitis）virus
Lihan Tick Virus
Mammalian retrovirus
　　　　retrovirus（Human immunodeficiency virus（略称HIV）1, 2を除く。）
Manawa virus
Marek's disease virus
Measles virus
Megrivirus
Meleagrid herpesvirus 2（別名Turkey herpesvirus）
Mobala virus
Modoc virus
Mojiang virus
Molluscum contagiosum virus
Monkeypox virus
Mopeia virus
Mukawa virus
Mumps virus
Munguba virus
Murid herpesvirus
Murine pneumonia virus（別名Pneumo virus of mice（略称PVM））
Murre virus
Myxoma virus
Nairobi sheep disease virus
Naples virus
Nelson Bay orthoreovirus
Nique virus
Norovirus
Nymanini virus
Odrenisrou virus
Oita virus
O'Nyong-Nyong virus
Orbivirus（African horse sickness virus を除き、Muko virusを含む。）
Orf virus
Oriximina virus
Orthobunyavirus（Jamestown Canyon virusを含む。）
Ovine herpesvirus１
　　　　（別名Ovine pulmonary adenomatosis associated herpesvirus）
Ovine herpesvirus 2
Oz virus
Palma virus
Papiine alphaherpesvirus 2
Papillomavirus
Parainfluenza virus
Parechovirus A（旧分類名Human parechovirus）
Parechovirus B（旧分類名Ljungan virus）
Parvovirus
　　　　（Adeno-associated virusを除く。）
Phocine morbillivirus
Pichinde virus
Poikilothermal vertebrate retrovirus
Polyomavirus
Porcine astrovirus
Porcine circovirus
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus
Porcine teschovirus
Precarious point virus
Prospect Hill virus
Pseudocowpox virus
Psittacine circovirus
Rabies lyssavirus（旧分類名Rabies virus）（固定株及び弱毒化株に限る。）
Razdan virus
Rhinovirus A（旧分類名Human rhinovirus A）
Rhinovirus B（旧分類名Human rhinovirus B）
Rhinovirus C（旧分類名Human rhinovirus C）
Rio Bravo virus
RML-105355 virus
Rodent hepacivirus
Ross river virus
Rotavirus
Rubella virus
Rukutama virus
Saimiriine gammaherpesvirus 2
Saint Floris virus
Salanga virus
Salehabad virus
Sandfly fever Naples phlebovirus
Sandfly fever Sicilian virus
Sapelovirus A（旧分類名Porcine sapelovirus）
Sapovirus
Semliki Forest virus（増殖力等欠損株に限る。）
Serra Norte virus
Sheeppox virus
Shope fibroma virus
Silverwater virus
Simian virus 5
Simian herpesvirus（Cercopithecine Herpesvirus 1
　　（別名B-virus）及びHerpes ateles virusを除く。）
Sindbis virus
Soft tick bunyavirus
Suid herpesvirus 1（別名Pseudorabies virus、Aujeszky’s disease virus）
Suid herpesvirus 2（別名Pig cytomegalovirus）
Swinepox virus
Swine vesicular disease virus
Tacaribe virus
Tacheng Tick virus 2
Tanapox virus
Tarumizu tick virus
Tehran virus
Thogoto virus 
Thottapalayam virus
Tofla virus
Toroviru
Torque teno（略称TT） virus
Tremovirus
Tula virus
Usutu virus
Uukuniemi virus
Varicella-zoster virus
Vesicular stomatitis Alagoas virus
Vesicular stomatitis Indiana virus
Vesicular stomatitis New Jersey virus
Vesivirus
White Water Arroyo virus
Woodchuck hepatitis virus
Yaba monkey tumor virus
Yokose virus
Yongjia Tick virus 1
Zaliv Terpenia virus
Zika virus
ロ 次に掲げるもの
Rinderpest virus
（生ワクチン株に限る。）
Vaccinia virus
（DIs株及びLC16m8株を除く。）

(1) 原核生物のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く。）
Bacillus anthracis
（34F2株及びDavis株を除く。）
Brucella属全種
Burkholderia mallei
Burkholderia pseudomallei
Coxiella burnetii
Francisella tularensis subsp. holarctica（LVS株を除く。）
Francisella tularensis subsp. mediasiatica
Francisella tularensis subsp. tularensis（B38株を除く。）
Morococcus cerebrosus
Mycobacterium tuberculosis var. africanum（ 旧分類名Mycobacterium africanum）
Mycobacterium tuberculosis var. bovis（旧分類名Mycobacterium bovis）
（BCG株を除く。）
Mycobacterium tuberculosis var. tuberculosis（ 旧分類名Mycobacterium tuberculosis）
Mycoplasma mycoides subsp.mycoides
（V株を除く。）
Orientia tsutsugamushi
Pasteurella multocida
（出血性敗血症又は家きんコレラ由来ではない株を除く。）
Rickettsia aeschlimannii
Rickettsia africae
Rickettsia akari
Rickettsia amblyommatis（旧分類名Rickettsia amblyommii）
Rickettsia australis
Rickettsia bellii
Rickettsia canadensis
Rickettsia conorii
Rickettsia felis
Rickettsia heilongjiangensis
Rickettsia helvetica
Rickettsia honei
Rickettsia japonica
Rickettsia massiliae
Rickettsia montanensis（旧分類名Rickettsia montana）
Rickettsia parkeri
Rickettsia prowazekii
Rickettsia raoultii
Rickettsia rhipicephali
Rickettsia rickettsii
Rickettsia sibirica
Rickettsia slovaca
Rickettsia typhi
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi
Yersinia pestis

(2) 真菌のうち、次に掲げるもの
　　（科学的知見により哺乳動物等に対する病原性がないとされているものを除く。）
Blastomyces dermatitidis
Coccidioides immitis
Coccidioides posadasii
Histoplasma属全種
Paracoccidioides braziliensis

(3) 真核生物を自然宿主とするウイルスのうち、次に掲げるもの
　　（承認生ワクチン株を除く。）
African horse sickness virus
African swine fever virus
Andes virus
Ash River virus
Bas-Congo tibrovirus
Bayou orthohantavirus
Bhanja virus
Black Creek Canal orthohantavirus
Camp Ripley virus
Cao Bang virus
Cedar virus
Cercopithecine herpesvirus 1（別名B-virus）
Chikungunya virus
Classical swine fever virus（別名Hog cholera virus）
Colorado tick fever virus
Dobrava virus
Eastern equine encephalitis virus
Foot-and-mouth disease virus
Guertu virus
Hantaan virus
Heartland virus
Herpes ateles virus
Human immunodeficiency virus
　　　　（略称HIV）1（増殖力等欠損株を除く。）2
Hunter island virus
Imjin virus
Influenza virusの高病原性株
　　　　（Highly pathogenic avian influenza virusを含む。）
Jemez Springs virus
Kyasanur Forest disease virus
Laguna Negra virus
Leopards Hill virus
Louping ill virus
Lumpy skin disease virus
Luna virus
Lyssavirus（Rabies lyssavirusを除く。）
Malsoor virus
Maporal virus
Mayaro virus
MERS coronavirus
Murray Valley encephalitis virus
Negishi virus
New York virus
Omsk hemorrhagic fever virus
Peste-des-pettiis ruminant virus
Powassan virus
Puumala virus
Rabies virus lyssavirus（旧分類名Rabies virus）（固定株及び弱毒化株を除く。）
Rift Valley fever virus
Rinderpest virus
Saaremaa virus
SARS coronavirus
SARS coronavirus 2
Seewis virus
Semliki Forest virus（増殖力等欠損株を除く。）
Seoul virus
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
Sin Nombre virus
St. Louis encephalitis virus
Tanganya virus
Thailand virus
Tick-borne encephalitis virus
　　　　（Russian spring-summer encephalitis virus を含む。）
Venezuelan equine encephalitis virus
West Caucasian bat virus
Western equine encephalitis virus
West Nile virus（Kunjin virusを含む。）
Yellow fever virus

真核生物を自然宿主とするウイルスのうち、次に掲げるもの
　　（承認生ワクチン株を除く。）
Bundibugyo ebolavirus
Chapare virus
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus
Cueva virus
Guanarito virus
Hendra virus Junin virus（Candid#1株を除く。）
Lassa virus
Lloviu cuevavirus
Lujo virus
Machupo virus
Marburg marburgvirus（旧分類名Lake Victoria marburgvirus）
Nipah virus
Reston ebolavirus
Sabia virus
Sudan ebolavirus
Tai Forest ebolavirus（別名Ivory Coast ebolavirus）
Variola virus（major,minor）
Wenling frogfish filovirus
Wenling thamnacinus septentrionalis filovirus
Zaire ebolavirus